La contaminación del lago Yanquihue en Chile es un problema multifacético que afecta su ecosistema. Las granjas salmoneras contribuyen a la contaminación por sedimentos, residuos de medicamentos y materia orgánica, lo que ha llevado a la municipalidad de Frutillar a solicitar su traslado a tierra firme.
La agricultura intensiva y la expansión urbana también impactan negativamente, arrastrando contaminantes y destruyendo hábitats naturales. Un problema clave son las aguas residuales, ya que muchas conexiones domiciliarias al alcantarillado no están regularizadas, provocando que los desechos lleguen directamente al lago o se filtren a través de napas subterráneas.
Como solución, se ha implementado un proyecto piloto de humedal artificial para filtrar contaminantes antes de que lleguen al lago. Esta tecnología, similar a los humedales depuradores, busca prevenir la contaminación y recuperar la calidad del agua, con la esperanza de que el lago Yanquihue se convierta en un modelo de soluciones ambientales a nivel mundial.