Se compara la tijera y el alambre en el arte del bonsai con el lápiz y la goma para un dibujante. Estas herramientas permiten "dibujar" la copa del árbol, posicionando las ramas según la visión del artista.
El alambre se utiliza para guiar el crecimiento de las ramas; una vez que el árbol adopta la nueva posición, el alambre se retira. La poda también es fundamental para dar forma y mantener la estructura del bonsai, permitiendo, por ejemplo, que ramas que de otro modo se superpondrían reciban sol por igual.