Existen indicios de abuso sexual en el caso de Agostina Vega, aunque no se pudieron realizar exámenes específicos debido al estado del cuerpo. Se realizaron otros exámenes que arrojaron "un indicio" de abuso sexual, y se espera que la comprobación definitiva llegue con datos complementarios.
Se plantea la hipótesis de que el móvil del crimen podría ser un "homicidio criminis causa", es decir, un asesinato cometido para asegurar el resultado de otro delito o lograr la impunidad. En este contexto, la violación podría haber sido el delito que se intentó encubrir, y el asesinato de Agostina se habría producido para tapar este hecho, dado que el agresor era conocido.