La Causa Cuadernos se vio envuelta en una polémica por la situación de Miriam Quiroga, ex secretaria privada de Néstor Kirchner, quien debía declarar y no era localizada. La fiscalía y el tribunal no lograban dar con ella, generando preocupación sobre la protección de testigos.
Finalmente, uno de los hijos de Quiroga se comunicó con el tribunal, informando que su madre reside en Córdoba y atraviesa una crisis nerviosa. La situación planteó interrogantes sobre cómo la justicia protege a los testigos, especialmente considerando que otros como Jorge Basigalupo y Diego Cabo ya declararon, y Hilda Rovis, exmujer de Oscar Centeno, también tiene una audiencia próxima.
Se reportó que varios testigos manifestaron haber recibido llamados y mensajes intimidantes antes de sus declaraciones, lo que subraya la fragilidad del sistema de protección.