La investigación sobre la muerte del fiscal Alberto Nisman, ocurrida en 2015, ha sido objeto de fuertes críticas por presuntas irregularidades y mal manejo de la escena del crimen. Se señala a la fiscal Fein por permitir la entrada de numerosas personas al departamento, no preservar adecuadamente las pruebas y no tomar las medidas necesarias para asegurar la integridad de la escena.
Se cuestiona la presencia de funcionarios como Berni y la manipulación de pruebas clave, como el arma encontrada en el departamento. La defensa de la fiscal Fein argumenta que actuó con la información disponible en ese momento, pero las críticas apuntan a que su accionar comprometió la investigación, al punto de que el tribunal que investiga el caso concluyó que la escena fue alterada deliberadamente para obstaculizar el avance.
A pesar de las controversias y el procesamiento de la fiscal Fein por encubrimiento agravado, Cristina Kirchner había elogiado su actuación en su momento. La investigación sobre la muerte de Nisman, quien había denunciado a la expresidenta por traición a la patria, sigue generando debate y cuestionamientos sobre la actuación de la justicia.